کلر در تنظیم تورژسانس برخی از گیاهان همراه با یون پتاسیم عمل می‌کند. این عنصر برای فتوسنتز ضروری بوده و نقش آن در انتقال الکترون‌ها از آب به کلروفیل میباشد. كلر نقش خود را عمدتاً بصورت یون كلر در پروسه‌هائی نظیر تنظیم اسمزی، سیگنالینگ سلولی، هوموستازی، جنبش روزنه، تکثیر و تمایز سلولی، جوانه زنی دانه ی گرده، تنظیم PH، بارگیری آوند چوبی، رشد لوله ی گرده و موازنه بار در گیاهان آلی ایفا می‌كند. معلوم شده است كه كلر برای شكستن مولكول آب در فتوسیستم مورد نیاز است. كلر همچنین می‌تواند بطور غیر مستقیم و از طریق تنظیم اسمزی بصورت یك آنیون متحرك برای پتاسیم بر رشد گیاهی تاثیر بگذارد. افزایش رشد گیاه در اثر مصرف كلر، می‌تواند ناشی از تاثیر این عنصر در محدود نمودن بیماری ها، مانند لكه خاكستری برگ در كوكونات، پاخوره در گندم، پژمردگی كاكل در ذرت و سفیدك پودری در ارزن باشد. كاربرد كودهای حاوی كلر به سبزیجات چند روز قبل از برداشت، می‌تواند غلظت نیترات در بافتها را از طریق جایگزینی كلر با نیترات كاهش دهد و در نتیجه كیفیت تغذیه ای سبزیجات را بالا ببرد.
